九州大學醫院的前身“贊生館”西洋醫學醫療機構成立于1867年，經過一百多年的發展，建設成為包含內科、外科、牙科、中央診療機構等多個科室在內的綜合型醫院。并于2003年正式更名為九州大學醫學部·齒學部·機體防御醫學研究所附屬醫院，簡稱九州大學醫院。2011年，醫院分院九州大學醫院別府醫院正式成立。